На удаленной машине в папку автозагрузка кладется файл cmdserv.exe, на локальной машине запускаем client.exe. В строке Host указываем сетевое имя удаленной машины либо Ip жмем Connect. После успешного соединения получаем доступ к коммандной строке (как Пуск - Выполнить). Запускать приложения можно как в обычном, так и в скрытом режиме (строка RUN). Можно просматривать список запущенных процессов и при потребности убивать.